Linux-Software am Fachbereich BCP

Siehe auch: Software am Fachbereich

Auf dieser Seite befindet sich der Schnappschuss einer Zusammenstellung der im BCPnet (also u.a. auf dem Login-Server und den Pool-PCs) installierten Software. Diese Liste erhebt keinen Anspruch auf Vollständigkeit und ist nicht immer aktuell. Bitte fragen Sie bei Bedarf nach oder loggen Sie sich einfach auf den Systemen ein und schauen Sie selbständig nach, was in welcher Version installiert ist.

DebiChem

• Debian-Science Chemie-Software aus dem DebiChem-Unterprojekt sollte weitgehend installiert sein

Einzelne Softwarepakete

• Anaconda2 (Python-Pakete: pymol, python-scipy, …)
• babel (openbabel: Transformation von Molekülkoordinaten)
• Gaussian 09 Quantenchemiepaket (Aufruf: rung09 myjob.com; auf login.bcp alternativ: rung09D01 myjob.com). Kurzinfo zu Gaussian 09; Gaussian, Inc.
• gle (graphics)
• gmolden (Variante von molden)
• gnuplot
• grace (siehe xmgrace)
• Gromacs
• latex (LaTeX)
• LinuxDoc sgml-tools: linuxdoc-tools, linuxdoc-tools-text, linuxdoc-tools-latex
• molden: a pre- and post processing program of molecular and electronic structure
• octave (ersetzt z.T. matlab)
• openbabel (siehe babel)
• PyEMMA
• tex (TeX)
• Turbomole
• VMD Visual Molecular Dynamics 1.9.3
• xmgrace (bzw. grace in Debian) zur Messwertdarstellung (hieß früher xmgr)