Röntgenstrukturanalyse-System XTAL
XTAL Version 3.2 ist ein Programmsystem zur Lösung, Verfeinerung und Ausgabe
(Listen und Graphik) von Strukturen sowohl kleiner als auch Makromoleküle
aus Röntgen- oder Neutronendaten. Es umfaßtmehr als 90
Einzelprogramme, von denen mehrere in einem Durchgang aufgerufen werden
können, wobei die Daten jewils von einem Programm an das nächste
weitergegeben werden. Die wichtigsten Programme für die Analyse
kleiner Moleküle sind:
- STARTX
- Einlesen der Kristallparameter
- ADDREF
- Einlesen und Verarbeitung der Reflexionsdaten (hkl-File)
- SORTRF
- Sortieren und Mitteln von Reflexdaten
- GENEV
- Berechnung normalisierter Strukturfaktoren
- GENSIN
- Erzeugen von Strukturinvarianten (Triplets und Quartets)
- GENTAN
- Phasenbestimmung nach der Tangensformel
- SIMPEL
- Phasenbestimmung nach der Symbolischen Addition
- PATSEE
- Patterson Search Programm
- ADDATM
- Eingabe von Atomparametern
- FC
- Berechnung von Strukturfaktoren
- CRYLSQ
- Least Squares-Verfeinerung von Strukturen
- FOURR
- Fourier-Transformation vom reziproken in den realen Raum
- PEKPIK
- Suche nach Maxima in einer 3d-Fourier-Map
- SLANT
- Fourier-Map in beliebiger Orientierung aus FOURR
- CONTRS
- Graphische Ausgabe von Konturlinien (FOURR oder SLANT)
- ORTEP
- Graphische Ausgabe von Molekülstrukturen
- PIG
- Interaktives Modelling-Programm
- PLOTX
- Plot-Ausgabe der graphischen Programme ORTEP und CONTRS
- BONDLA
- Berechnung von Bindungslängen und -winkeln
- LSQPL
- Kleinste Quadrate-Ebenen und -geraden
- REGWT
- Analyse und Bewichtung von Strukturfaktordaten
- PIGW
- wie PIG, aber mit direkter Benutzung der X11-Library
(wesentlich schneller als über gks). Gerätename X11LIB
- PREVUE
- (nicht im Manual beschrieben) Ein neues Programm, das die
Manipulation von Labels in ORTEP-Plots (Verschieben etc.) erlaubt.
Gerätename X11LIB.
Für die Plotausgabe der Programme PLOTX und PIG
stehen alle Geräte der Library
gks (Graphisches Kern System) zur Verfügung (Gerätenamen
GKSFIL (gks-Metafile), POSTP (Postscript) und XTERM (X-Terminal).
- Lokation:
- /software/xtal32 und Subdirectories. Version 3.0 steht unter
/usr/local/bin/xtal noch zur Verfügung.
- Aufruf:
- Es steht eine Kommando-Prozedur xtal zur Verfügung, mit der
sowohl für interaktiven als auch für
Batch-Betrieb das System mit den Parametern Input-File, hkl-File,
Atom-File und Output-File aufgerufen werden kann (Aufruf ohne
Parameter gibt eine Beschreibung des Aufrufs). Die Version 3.0 kann
durch xtal3 aufgerufen werden.
- Information:
- Es stehen leider nur gedruckte Manuals zur Verfügung (im IKr und im
IAC).
- Voraussetzungen:
-
gks-Library , X11 für Plotausgabe
- Autoren:
- S.R. Hall, J.M. Stewart und viele andere
- Ansprechpartner:
-
W. Dreißig
- Zusatzinformationen:
-
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Wolfgang Dreißig, 21. Juni 1993