NMR-Simulationsprogramme sim-hhh, sim-hhhh

1. Anleitung für den Gebrauch der Simulationsprogramme
2. DOS-Programme im Microcomputerraum
3. Unix-Version im CHEMnet

Anleitung für den Gebrauch der Simulationsprogramme

Man benötigt dafür:

• die Hauptprogramme sim-hhh.exe bzw. sim-hhhh.exe
• eine Eingabedatei, zum Beispiel test
• eine Ausgabedatei, zum Beispiel aus

Zum Starten des Programmes werden die drei Dateinamen nacheinander in die Kommandozeile eingetippt:

sim-hhh test aus <RETURN>

Auf dem Bildschirm erscheint dann das berechnete Spektrum. Oberhalb des Spektrums erscheinen in der ersten Zeile die zu diesem Spektrum gehörende Temperatur und ein Text, der sinnvollerweise das System beschreibt. Die Zahlenwerte sind die zum Spektrum gehörenden Parameter wie Kopplungskonstanten, Geschwindigkeitskonstanten, natürliche Halbwertsbreite und chemische Verschiebungen. Man kann nun durch Eingabe der Nummer und des neuen Wertes (durch Leerzeichen getrennt) die jeweiligen Parameter verändern.

Beispiel:

4 25 <RETURN>

ändert den Parameter 4 auf den Wert 25.

1. Dreispinsystem

1. Chem. Verschiebung 1
2. Chem. Verschiebung 2
3. Chem. Verschiebung 3
4. Halbwertsbreite
6. J_12
7. J_13
8. J_23
9. k_12
10. k_13
11. k_23

Der Datensatz hat folgende Struktur:

0 18 1

Graphikinformationen

120 '3-Spin-System'

Temperatur, Text

3000 2000 1000

Chem. Verschiebungen 1, 2, 3 [Hz]

30

Halbwertsbreite

200 100 50

J_12, J_13, J_23 [Hz]

.00100 .00130 0.00115

k_12, k_13, k_23 [s^(-1)]

4000 -1000 10 300. 4000. 40. 1 0

Frequenzgrenzen und Skalierung

0 0

Phasenkorrektur

-1

Schlußmarkierung

2

2. Vierspinsystem

1. Chem. Verschiebung 1
2. Chem. Verschiebung 2
3. Chem. Verschiebung 3
4. Chem. Verschiebung 4
5. Halbwertsbreite
6. J_12
7. J_13
8. J_14
9. J_23
10. J_24
11. J_34
12. k_12
13. k_13
14. k_14
15. k_23
16. k_24
17. k_34

Der dazugehörige Datensatz:

0 16 1

Graphikinformationen

0 'AA"XX" '

Temperatur, Text

20 20 35.2 35.2

Chem. Verschiebungen 1, 2, 3, 4 [Hz]

0.2

Halbwertsbreite

7.50 8.10 1.50 1.5 8.10 0.3

J_12, J_13, J_14, J_23, J_24, J_34 [Hz]

0.0001 0.0001 0.0001 0.0001 0.0001 0.0001

k_12, k_13, k_14, k_23 k_24, k_34 [s^(-1)]

100 0 .1 300 50 70 1 0

Frequenzgrenzen und Skalierung

0 0

Phasenkorrektur

-1

Schlußmarkierung

2

Mit der Eingabe

0 0 <RETURN>

wird das Programm verlassen. In der erzeugten Ausgabedatei stehen die Ergebnisse der Rechnung:

• Diagonalisierte Matrix
• Lage der Übergänge

DOS-Programme im Microcomputerraum

nfs <RETURN>

Die Programme und Eingabedateien stehen unterhalb von

E:\nmr_sim

E:\NMR_SIM\SIM3SPIN
E:\NMR_SIM\SIM4SPIN

Als Arbeitsverzeichnis sollten Sie C:\TMP bzw. D:\TMP wählen. Am besten, Sie kopieren sich die gewünschten Eingabedateien dorthin. Sie können auch die Programmdateien sim-hhh.exe bzw. sim-hhhh.exe dorthin kopieren. Anderenfalls muß der komplette Pfadname angegeben werden:

E:\NMR_SIM\SIM3SPIN\sim-hhh test aus <RETURN>
E:\NMR_SIM\SIM4SPIN\sim-hhhh aabb aus <RETURN>

Abschalten von NFS:

nonfs <RETURN>

Unix-Version im CHEMnet

Sie sollten beachten, daß das Programm einige Dateien anlegt. Daher empfiehlt es sich, zunächst in ein geeignetes Verzeichnis zu wechseln.

Eingabedateien stehen im folgenden Verzeichnis:

/software/db/nmr_sim/sim4spin

Aufruf:

Die Anzeige des Spektrums erfolgt mittels xmgr.